Gruven eier, Arthur Devlin, skaper en konflikt for mange av innbyggerne i Manifest, inkludert Ned Gillen. Devlin fungerer mennene for hardt, betaler dem dårlig, og mater etniske fordommer. Han forlater gruvearbeiderne motløs og fortvilet.
Gideon er i konflikt med seg selv når han klandrer seg selv for drapet på dem han elsker. Han mener at han er en “jinx” og tviler på hans verdi til sine venner og datter.
Den Spanskesyken som treffer Manifest i 1918 er en konflikt som følge av natur. Menneskene gjør sitt beste for å bekjempe sykdommen, men Manifest mister mange av sine innbyggere til denne dødelige sykdommen.
Mange av innvandrerne i Manifest føler begrenset av samfunnets fordommer. Miss Sadie føler vekten av fordommer. Fordi hun ikke ønsker å bringe skam og avvisning på sønnen som en dårlig ungarsk innvandrer, gir hun ham til å bli oppdratt av en fremmed som hun ser dessverre på avstand. Lokalbefolkningen spre rykter om henne og la henne leve i isolasjon.