Mr. Popper er et hus maler i Stillwater. Admiral Drake sender Mr. Popper, en af hans største fans, en pingvin som en overraskelse. Den pingvin hedder Captain Cook og sover i isen kassen.
KLIMAKS
Captain Cook synes ikke at være godt, så Mr. Popper kontakter et akvarium. De beslutter at pingvinen er ensom og har brug for en ledsager. Med to pingviner, Mr. Popper installerer en indefrysning maskine, der stammer på familiens budget.
DALENDE AKTIVITET
Greta lægger ti æg! Normalt behøver pingviner ikke lå, som mange, men ekstraordinære ting ske i ekstraordinære omstændigheder. Nu vil der være tolv pingvin munde at mætte!
LØSNING
De Poppers har sådan en hård tid at betale for alle deres udgifter, Mr. Popper beslutter sig for at træne pingvinerne. Under en vellykket rundtur i deres omrejsende show, de ankommer til den forkerte teater og teater ejeren har dem alle arresteret.
Admiral Drake betaler kaution for Mr. Popper. En Hollywood-film instruktør tilbyder at funktionen pingvinerne i filmene. Af frygt for, at livet i Hollywood ville være for meget for pingviner, Mr. Popper falder.
Admiral Drake, Mr. Popper, og pingvinerne rejse til Nordpolen på en ekspedition for at etablere en pingvin koloni.