Prvotno su dva broda trebala isploviti. Međutim, drugi brod, nazvan Speedwell, imao je veliko curenje i Hodočasnici su bili prisiljeni ugurati mnogo dodatnih putnika na Mayflower.
Budući da je na Mayfloweru bilo toliko ljudi, za vrijeme putovanja nisu imali ni približno dovoljno vode. Mnogi su ljudi oboljeli zbog nedostatka vode i prehrane.
Brod je pretrpio mnoge oluje. Jedna od oluja bila je toliko loša da je pukla jedna od glavnih zraka.