Luonnontieteiden opettajat luottavat usein analogioihin ja vertailuihin auttaakseen opiskelijoita hahmottamaan, miltä atomi "näyttää". Seuraavien toimintojen tarkoituksena on auttaa oppilaita ymmärtämään atomia, sillä se toimii perustana muulle kemialle ja sillä on tärkeä rooli monissa fysiikan osissa.